寇克艦長仍率領聯邦星艦企業號,進行例行性訓練任務,但他卻意欲求去,讓這次太空任務成為他的職場生涯中的最後一次任務。但寇克的死對頭可汗卻從獄中脫逃,並劫走極秘密的「創世計劃」,最後找上他的敵人寇克決一死戰…