劇場版忍者亂太郎毒菇忍者隊最強之軍師是一部集合動畫、喜劇元素的電影，香港上映時間暫定為2025年4月17日。
土井老師接受日落黃昏城忍者諸泉尊奈門的挑戰後下落不明，忍術學校的山田老師和六年級生們隨即展開全面搜索。局勢正陷入混亂，六年級生奉命調查毒菇城正在策劃的某種陰謀，但在行動之中，遭毒菇的軍師——「天鬼」突然現身攔截……令人震驚的是，天鬼的樣貌竟與土井老師長得一模一樣？ 土井老師神秘失蹤，「天鬼」究竟是何方神聖……？ 面對強敵，亂太郎，小丸和新丁和忍蛋們必須團結一致，才能渡過這個前所未有的難關，他們最終能否成功救回土井老師？
劇場版忍者亂太郎毒菇忍者隊最強之軍師主要語言為日語 (中英文字幕)，未有通訊事務管理局評級結果。
《劇場版忍者亂太郎毒菇忍者隊最強之軍師》以被日本人譽為「元祖國民初戀」的土井老師作為主角。因為他神秘失蹤，學藝不精的亂太郎、小丸、新丁和忍蛋們必須團結一致，運用半桶水忍術迎戰這個前所未有的難關，爆笑「營救」他們心愛的土井老師。一班忍蛋與土井老師勇闖一場溫暖又熱血的歷險。 電影早前於日本上映大受歡迎，票房衝破15億日元，創下系列劇場版最佳成績！日本觀眾好評不斷，零負評盛讚觀影後的幸福感讓人久久難以忘懷。《忍者亂太郎》作者尼子騷兵衛也大讚導演藤森雅也細膩呈現土井老師和小丸深厚的羈絆，他們之間的默契和關愛，無須言語也藉由許多細節表現得淋漓盡致，讓人勾起純真的感動。