午夜凶靈現在已經落畫，香港的公映時間是2000年4月22日。
森田醫院院長森田健三突然離奇失蹤，其獨生女由美（山口紗彌加飾）便全心投力追查父親的下落。然而其實不只有她父親，近來在這家醫院裡就接二連三傳出醫師或護士相繼失蹤的案件。在一個偶然的機會下，由美邂逅了一位住院就醫的大學生－佐藤文仁（窪塚洋介飾）。於是兩人決定齊心協力一同破解這謎團。終於發現在這一連串詭譎事件的背後隱藏了一位謎樣的少女。而這少女正是在院長健三失蹤前數日的深夜裡，被送來急救的病患。但令人百思不解的是，手術後，這位眼角下顆有顆痣的少女的頭顱竟然被取下。之後，凡執行這次手術的醫師皆一個個消失不見…結果，在醫院地下室發現了健三記錄這顆頭顱的手記，翻開裡頭赫然全是寫滿這少女的名字“富江、富江、富江、富江、富江”…最後，在由美的努力下，健三終於回到她身邊，只是他卻有一百八十度的轉變，不再是她原來的父親…。